Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QRK9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QRK9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QRK9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QRK9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QRK9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QRK9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QRK9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QRK9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QRK9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QRK9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QRK9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QRK9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QRK9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QRK9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QRK9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QRK9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QRK9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QRK9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QRK9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QRK9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QRK9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QRK9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QRK9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QRK9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QRK9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QRK9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QRK9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QRK9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QRK9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QRK9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QRK9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QRK9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QRK9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QRK9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QRK9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QRK9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QRK9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QRK9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QRK9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QRK9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QRK9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QRK9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QRK9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QRK9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QRK9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QRK9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QRK9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QRK9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QRK9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QRK9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QRK9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QRK9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QRK9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QRK9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QRK9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QRK9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QRK9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QRK9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QRK9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QRK9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QRK9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QRK9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QRK9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QRK9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QRK9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QRK9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QRK9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QRK9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QRK9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QRK9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QRK9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QRK9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QRK9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QRK9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QRK9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QRK9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QRK9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QRK9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QRK9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QRK9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QRK9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QRK9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QRK9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QRK9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QRK9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QRK9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QRK9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QRK9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QRK9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QRK9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
J3QRK9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
J3QRK9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
J3QRK9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
J3QRK9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QRK9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QRK9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QRK9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QRK9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QRK9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms