Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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