Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B4DEV8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B4DEV8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B4DEV8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B4DEV8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B4DEV8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B4DEV8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
B4DEV8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B4DEV8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B4DEV8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
B4DEV8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DEV8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DEV8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DEV8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DEV8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DEV8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DEV8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DEV8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DEV8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DEV8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DEV8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DEV8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DEV8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DEV8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DEV8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DEV8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DEV8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DEV8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DEV8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DEV8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DEV8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DEV8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DEV8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DEV8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DEV8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DEV8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DEV8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DEV8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DEV8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DEV8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DEV8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DEV8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DEV8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DEV8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DEV8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DEV8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DEV8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DEV8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DEV8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DEV8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DEV8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DEV8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DEV8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DEV8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DEV8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DEV8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DEV8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DEV8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DEV8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DEV8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DEV8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DEV8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DEV8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DEV8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DEV8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DEV8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DEV8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DEV8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DEV8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DEV8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms