Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms