Protein–RNA interactions for Protein: A6NDG6

PGP, Glycerol-3-phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPA6NDG6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms