Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 HAUS2-201ENST00000260372 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 ZSCAN32-201ENST00000304926 3027 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 TRIM6-203ENST00000380107 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 FBN2-208ENST00000619499 10154 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC092329.4-202ENST00000638174 1989 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 CCDC15-201ENST00000344762 3893 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 GABRR3-203ENST00000621172 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 MAPK10-296ENST00000641283 2826 ntAPPRIS P2 BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 SIM1-202ENST00000369208 8430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 CCAR1-218ENST00000630771 4540 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC135178.2-201ENST00000582471 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 IL17RD-202ENST00000320057 4474 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 RAB27A-202ENST00000396307 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 SLF2-201ENST00000238961 7288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 CD109-202ENST00000422508 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 MAPK10-319ENST00000641459 2542 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 PROX2-202ENST00000556489 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 NUMB-231ENST00000559312 1439 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 TRPM3-211ENST00000396280 4671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 PRDM11-206ENST00000622142 10730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 ESRRG-221ENST00000493603 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 LINC00933-201ENST00000557887 2606 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 ARHGDIB-201ENST00000228945 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 RN7SKP261-201ENST00000410948 278 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 LINC01066-201ENST00000415283 399 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 LINC00423-201ENST00000421002 903 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC138207.1-201ENST00000442757 545 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 OR5M4P-201ENST00000529436 925 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC025040.1-201ENST00000560375 1284 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 RASSF2-201ENST00000379376 5282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 LL22NC03-63E9.3-201ENST00000407120 3111 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC004941.1-201ENST00000417506 3120 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 UGT2B28-202ENST00000511240 1525 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 USP37-204ENST00000418019 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 KLHL8-208ENST00000512111 3245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 STXBP5-AS1-209ENST00000606831 2025 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AHCTF1-202ENST00000366508 8751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 PTBP3-203ENST00000343327 2755 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 KPNB1-201ENST00000290158 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 SP140-204ENST00000417495 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 U91328.2-201ENST00000606723 4130 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 CASP14-201ENST00000427043 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AL445231.1-201ENST00000445523 1814 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 MAPK10-204ENST00000395157 2665 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 MXI1-203ENST00000361248 2188 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 DNAAF4-203ENST00000448430 1445 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 ZNF468-201ENST00000243639 4027 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 DDX52-213ENST00000617633 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 EREG-201ENST00000244869 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 RIT2-201ENST00000326695 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 RFX3-202ENST00000358730 2971 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 LINC00271-203ENST00000438618 1202 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AL033379.1-201ENST00000442184 481 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC079362.1-202ENST00000547089 278 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AL355922.4-201ENST00000555642 449 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 LINC02289-202ENST00000556781 861 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AL451054.1-201ENST00000621770 772 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC106869.1-203ENST00000419035 1892 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 NLRP4-201ENST00000301295 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 ADAMTS20-201ENST00000389420 6076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 MXRA7-207ENST00000592148 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 RPS20-205ENST00000519807 1826 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 NF1P1-201ENST00000604105 2645 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 NAA11-201ENST00000286794 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 LINC00689-203ENST00000438049 3946 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 SCN10A-201ENST00000449082 6418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 CLK1-201ENST00000321356 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 ZMYND8-202ENST00000311275 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 EMC1-207ENST00000477853 6664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 BUB1B-201ENST00000287598 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 ITGA10-204ENST00000539363 4735 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AL627308.2-201ENST00000420014 432 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 Z97198.1-201ENST00000452366 658 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC233724.10-201ENST00000510454 409 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 CDC37L1-AS1-201ENST00000607997 463 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC005609.2-201ENST00000623320 592 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC129908.1-201ENST00000624553 648 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 BCL2L11-224ENST00000639340 243 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 GNA12-203ENST00000407904 3918 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 SND1-IT1-201ENST00000623342 2481 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms