Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHLDA3Q9Y5J5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHLDA3Q9Y5J5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHLDA3Q9Y5J5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHLDA3Q9Y5J5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHLDA3Q9Y5J5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHLDA3Q9Y5J5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHLDA3Q9Y5J5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHLDA3Q9Y5J5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHLDA3Q9Y5J5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHLDA3Q9Y5J5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHLDA3Q9Y5J5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHLDA3Q9Y5J5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHLDA3Q9Y5J5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHLDA3Q9Y5J5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHLDA3Q9Y5J5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms