Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms