Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI0

ATAD2B, ATPase family AAA domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2BQ9ULI0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ATAD2BQ9ULI0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ATAD2BQ9ULI0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ATAD2BQ9ULI0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
ATAD2BQ9ULI0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ATAD2BQ9ULI0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ATAD2BQ9ULI0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ATAD2BQ9ULI0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
ATAD2BQ9ULI0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
ATAD2BQ9ULI0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ATAD2BQ9ULI0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ATAD2BQ9ULI0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ATAD2BQ9ULI0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ATAD2BQ9ULI0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ATAD2BQ9ULI0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
ATAD2BQ9ULI0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ATAD2BQ9ULI0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
ATAD2BQ9ULI0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ATAD2BQ9ULI0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ATAD2BQ9ULI0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ATAD2BQ9ULI0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ATAD2BQ9ULI0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ATAD2BQ9ULI0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ATAD2BQ9ULI0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ATAD2BQ9ULI0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ATAD2BQ9ULI0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ATAD2BQ9ULI0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ATAD2BQ9ULI0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ATAD2BQ9ULI0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ATAD2BQ9ULI0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ATAD2BQ9ULI0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ATAD2BQ9ULI0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ATAD2BQ9ULI0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ATAD2BQ9ULI0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ATAD2BQ9ULI0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ATAD2BQ9ULI0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ATAD2BQ9ULI0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
ATAD2BQ9ULI0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ATAD2BQ9ULI0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
ATAD2BQ9ULI0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ATAD2BQ9ULI0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ATAD2BQ9ULI0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ATAD2BQ9ULI0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ATAD2BQ9ULI0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms