Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GJD2Q9UKL4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms