Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI6

TFCP2L1, Transcription factor CP2-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2L1Q9NZI6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2L1Q9NZI6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFCP2L1Q9NZI6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms