Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMPD3Q9NY59 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms