Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH9

SLTM, SAFB-like transcription modulator, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLTMQ9NWH9 EPS8L2-203ENST00000524763 580 ntTSL 319.82■□□□□ 0.762e-6■■□□□ 12.7
SLTMQ9NWH9 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.332e-6■■□□□ 12.7
SLTMQ9NWH9 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.322e-6■■□□□ 12.7
SLTMQ9NWH9 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.232e-6■■□□□ 12.7
SLTMQ9NWH9 EPS8L2-208ENST00000526909 3844 ntTSL 513.43□□□□□ -0.262e-6■■□□□ 12.7
SLTMQ9NWH9 ASPSCR1-216ENST00000583503 641 ntTSL 318.43■□□□□ 0.542e-7■■□□□ 12.7
SLTMQ9NWH9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.767e-9■■□□□ 12.7
SLTMQ9NWH9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.791e-6■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.054e-6■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 ZCCHC14-204ENST00000568020 6242 ntTSL 1 (best)13.91□□□□□ -0.184e-6■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 TANGO2-218ENST00000462579 649 ntTSL 416.7■□□□□ 0.268e-7■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 AP3D1-209ENST00000591284 580 ntTSL 519.82■□□□□ 0.764e-9■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.664e-9■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.584e-9■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 BRD4-208ENST00000597315 892 ntTSL 527.98■■■□□ 2.072e-7■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.72e-7■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.042e-7■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 BRD4-205ENST00000594841 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)15.59■□□□□ 0.092e-7■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 BRD4-210ENST00000601941 604 ntTSL 513.05□□□□□ -0.322e-7■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.562e-6■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 AC016723.1-202ENST00000436982 643 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.911e-6■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.11e-6■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.031e-6■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 PQLC1-206ENST00000474967 2319 ntTSL 521.45■■□□□ 1.021e-6■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 PQLC1-201ENST00000351365 2414 ntTSL 219.92■□□□□ 0.781e-6■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 PQLC1-204ENST00000466449 2887 ntTSL 218.4■□□□□ 0.541e-6■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 TACC1-212ENST00000521050 491 ntTSL 1 (best)17.49■□□□□ 0.392e-6■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 TACC1-216ENST00000521642 493 ntTSL 1 (best)16.38■□□□□ 0.212e-6■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 TACC1-222ENST00000522752 944 ntTSL 1 (best)13.94□□□□□ -0.182e-6■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 TACC1-208ENST00000520340 1976 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.232e-6■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 TACC1-223ENST00000522904 1724 ntTSL 513.37□□□□□ -0.272e-6■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 TACC1-204ENST00000518415 3011 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.662e-6■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.052e-6■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.052e-6■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.527e-7■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 F7-203ENST00000444337 564 ntTSL 520.72■□□□□ 0.913e-6■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.423e-6■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.332e-8■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 GET4-205ENST00000441491 682 ntTSL 515.83■□□□□ 0.127e-7■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 SLC19A1-203ENST00000417954 3572 ntTSL 1 (best)15.63■□□□□ 0.092e-8■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.067e-7■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 GET4-203ENST00000412734 873 ntTSL 215.41■□□□□ 0.067e-7■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 AGAP3-214ENST00000476375 1019 ntTSL 513.78□□□□□ -0.21e-6■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 AL109613.1-203ENST00000417401 504 ntTSL 313.16□□□□□ -0.32e-8■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 F7-206ENST00000541084 2873 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.43e-6■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 F7-202ENST00000375581 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.493e-6■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 AL109613.1-205ENST00000446684 714 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.712e-8■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 GNB1-202ENST00000434686 684 ntTSL 310.42□□□□□ -0.745e-6■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 AL109613.1-204ENST00000412628 172 ntTSL 35.02□□□□□ -1.612e-8■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 EHBP1-213ENST00000462441 332 ntTSL 34.84□□□□□ -1.634e-6■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.374e-18■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 SLC6A8-210ENST00000485324 2401 ntTSL 221.8■■□□□ 1.082e-10■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 LDLR-206ENST00000557958 1881 ntTSL 217.85■□□□□ 0.452e-10■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 SH3BP4-205ENST00000444916 570 ntTSL 414.66□□□□□ -0.061e-6■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 SH3BP4-206ENST00000446904 829 ntTSL 310.64□□□□□ -0.711e-6■■□□□ 12.6
SLTMQ9NWH9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.22e-8■■□□□ 12.5
SLTMQ9NWH9 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.315e-7■■□□□ 12.5
SLTMQ9NWH9 SPG7-206ENST00000562775 1595 ntTSL 1 (best)14.63□□□□□ -0.072e-9■■□□□ 12.5
SLTMQ9NWH9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.662e-10■■□□□ 12.5
SLTMQ9NWH9 TRAF4-211ENST00000478021 718 ntTSL 323.58■■□□□ 1.373e-6■■□□□ 12.5
SLTMQ9NWH9 LIME1-210ENST00000621325 2410 ntTSL 222.61■■□□□ 1.212e-10■■□□□ 12.5
SLTMQ9NWH9 LIME1-203ENST00000465591 680 ntTSL 222.55■■□□□ 1.22e-10■■□□□ 12.5
SLTMQ9NWH9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.882e-10■■□□□ 12.5
SLTMQ9NWH9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.822e-10■■□□□ 12.5
SLTMQ9NWH9 LPCAT1-204ENST00000507282 417 ntTSL 217.69■□□□□ 0.424e-6■■□□□ 12.5
SLTMQ9NWH9 ASPSCR1-213ENST00000582355 1246 ntTSL 524.54■■□□□ 1.521e-7■■□□□ 12.5
SLTMQ9NWH9 ASPSCR1-219ENST00000584454 1919 ntTSL 1 (best)23.93■■□□□ 1.421e-7■■□□□ 12.5
SLTMQ9NWH9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.371e-7■■□□□ 12.5
SLTMQ9NWH9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.311e-7■■□□□ 12.5
SLTMQ9NWH9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.291e-7■■□□□ 12.5
SLTMQ9NWH9 NFE2L2-210ENST00000462023 521 ntTSL 216.15■□□□□ 0.183e-7■■□□□ 12.5
SLTMQ9NWH9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.676e-7■■□□□ 12.4
SLTMQ9NWH9 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.066e-7■■□□□ 12.4
SLTMQ9NWH9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.173e-6■■□□□ 12.4
SLTMQ9NWH9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.013e-6■■□□□ 12.4
SLTMQ9NWH9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.963e-6■■□□□ 12.4
SLTMQ9NWH9 UBE2I-210ENST00000562482 735 ntTSL 216.77■□□□□ 0.289e-7■■□□□ 12.4
SLTMQ9NWH9 AHNAK-203ENST00000525875 793 ntTSL 311.13□□□□□ -0.635e-11■■□□□ 12.4
SLTMQ9NWH9 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC11.97□□□□□ -0.492e-7■■□□□ 12.4
SLTMQ9NWH9 SHANK2-216ENST00000482659 381 ntTSL 34.76□□□□□ -1.651e-6■■□□□ 12.4
SLTMQ9NWH9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.071e-6■■□□□ 12.4
SLTMQ9NWH9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.493e-6■■□□□ 12.4
SLTMQ9NWH9 IL18BP-203ENST00000343898 1720 ntTSL 1 (best)17.06■□□□□ 0.322e-6■■□□□ 12.4
SLTMQ9NWH9 PLXDC2-203ENST00000377252 12468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.843e-6■■□□□ 12.4
SLTMQ9NWH9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.994e-9■■□□□ 12.4
SLTMQ9NWH9 PIGG-207ENST00000504187 1784 ntTSL 217.66■□□□□ 0.425e-6■■□□□ 12.3
SLTMQ9NWH9 PIGG-212ENST00000506898 832 ntTSL 316.83■□□□□ 0.285e-6■■□□□ 12.3
SLTMQ9NWH9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.48e-8■■□□□ 12.3
SLTMQ9NWH9 ESYT2-202ENST00000275418 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 522.02■■□□□ 1.128e-8■■□□□ 12.3
SLTMQ9NWH9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.881e-13■■□□□ 12.3
SLTMQ9NWH9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.618e-8■■□□□ 12.3
SLTMQ9NWH9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.58e-8■■□□□ 12.3
SLTMQ9NWH9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.481e-13■■□□□ 12.3
SLTMQ9NWH9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.32■□□□□ 0.361e-13■■□□□ 12.3
SLTMQ9NWH9 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.251e-13■■□□□ 12.3
SLTMQ9NWH9 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.241e-13■■□□□ 12.3
SLTMQ9NWH9 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.28e-8■■□□□ 12.3
SLTMQ9NWH9 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.188e-8■■□□□ 12.3
SLTMQ9NWH9 AC079062.1-202ENST00000581011 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.88e-8■■□□□ 12.3
SLTMQ9NWH9 AC079062.1-201ENST00000584544 1396 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.888e-8■■□□□ 12.3
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