Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms