Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms