Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BIN3Q9NQY0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms