Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRM3Q9NNZ6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms