Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms