Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms