Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM2

DPCD, Protein DPCD, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPCDQ9BVM2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DPCDQ9BVM2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DPCDQ9BVM2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms