Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms