Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms