Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms