Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.6 ms