Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms