Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SVOPQ8N4V2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms