Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRC1

C4orf50, Uncharacterized protein C4orf50, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf50Q6ZRC1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf50Q6ZRC1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf50Q6ZRC1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms