Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEPROQ6NW34 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms