Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C10orf55Q5SWW7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms