Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms