Protein–RNA interactions for Protein: Q569G3

C5orf47, Uncharacterized protein C5orf47, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf47Q569G3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C5orf47Q569G3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C5orf47Q569G3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms