Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
KRTAP20-1Q3LI63 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
KRTAP20-1Q3LI63 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP20-1Q3LI63 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms