Protein–RNA interactions for Protein: Q1X8D7

LRRC36, Leucine-rich repeat-containing protein 36, humanhuman

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Length 754 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC36Q1X8D7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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LRRC36Q1X8D7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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LRRC36Q1X8D7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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LRRC36Q1X8D7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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LRRC36Q1X8D7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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LRRC36Q1X8D7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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LRRC36Q1X8D7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms