Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USF2Q15853 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
USF2Q15853 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USF2Q15853 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USF2Q15853 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USF2Q15853 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
USF2Q15853 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USF2Q15853 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USF2Q15853 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USF2Q15853 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
USF2Q15853 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USF2Q15853 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USF2Q15853 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USF2Q15853 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USF2Q15853 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
USF2Q15853 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USF2Q15853 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USF2Q15853 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USF2Q15853 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
USF2Q15853 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USF2Q15853 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USF2Q15853 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USF2Q15853 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USF2Q15853 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USF2Q15853 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
USF2Q15853 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USF2Q15853 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USF2Q15853 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USF2Q15853 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USF2Q15853 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USF2Q15853 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USF2Q15853 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USF2Q15853 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USF2Q15853 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USF2Q15853 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USF2Q15853 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USF2Q15853 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USF2Q15853 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USF2Q15853 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USF2Q15853 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USF2Q15853 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USF2Q15853 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USF2Q15853 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USF2Q15853 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USF2Q15853 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USF2Q15853 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USF2Q15853 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USF2Q15853 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USF2Q15853 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USF2Q15853 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USF2Q15853 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USF2Q15853 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USF2Q15853 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
USF2Q15853 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USF2Q15853 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
USF2Q15853 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USF2Q15853 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
USF2Q15853 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USF2Q15853 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USF2Q15853 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USF2Q15853 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USF2Q15853 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USF2Q15853 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USF2Q15853 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USF2Q15853 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USF2Q15853 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USF2Q15853 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USF2Q15853 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USF2Q15853 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USF2Q15853 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USF2Q15853 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USF2Q15853 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USF2Q15853 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USF2Q15853 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
USF2Q15853 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USF2Q15853 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USF2Q15853 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USF2Q15853 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USF2Q15853 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USF2Q15853 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USF2Q15853 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USF2Q15853 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USF2Q15853 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USF2Q15853 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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