Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBR1Q14596 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms