Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms