Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms