Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPB1Q06547 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPB1Q06547 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPB1Q06547 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPB1Q06547 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPB1Q06547 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPB1Q06547 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPB1Q06547 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPB1Q06547 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPB1Q06547 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPB1Q06547 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPB1Q06547 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPB1Q06547 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPB1Q06547 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPB1Q06547 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms