Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms