Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms