Protein–RNA interactions for Protein: P69891

HBG1, Hemoglobin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBG1P69891 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBG1P69891 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBG1P69891 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBG1P69891 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBG1P69891 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBG1P69891 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBG1P69891 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBG1P69891 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBG1P69891 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBG1P69891 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBG1P69891 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HBG1P69891 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBG1P69891 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBG1P69891 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBG1P69891 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBG1P69891 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBG1P69891 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HBG1P69891 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HBG1P69891 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HBG1P69891 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HBG1P69891 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HBG1P69891 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HBG1P69891 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HBG1P69891 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HBG1P69891 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HBG1P69891 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HBG1P69891 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HBG1P69891 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HBG1P69891 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HBG1P69891 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HBG1P69891 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HBG1P69891 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HBG1P69891 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HBG1P69891 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HBG1P69891 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HBG1P69891 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HBG1P69891 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HBG1P69891 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HBG1P69891 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HBG1P69891 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HBG1P69891 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HBG1P69891 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HBG1P69891 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HBG1P69891 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HBG1P69891 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBG1P69891 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBG1P69891 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBG1P69891 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBG1P69891 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBG1P69891 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBG1P69891 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBG1P69891 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBG1P69891 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBG1P69891 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBG1P69891 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBG1P69891 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBG1P69891 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBG1P69891 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBG1P69891 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBG1P69891 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBG1P69891 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBG1P69891 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBG1P69891 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBG1P69891 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HBG1P69891 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms