Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELLP55199 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELLP55199 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELLP55199 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELLP55199 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELLP55199 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELLP55199 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELLP55199 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELLP55199 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELLP55199 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELLP55199 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELLP55199 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELLP55199 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ELLP55199 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELLP55199 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELLP55199 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ELLP55199 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELLP55199 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELLP55199 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELLP55199 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELLP55199 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELLP55199 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELLP55199 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELLP55199 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELLP55199 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELLP55199 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELLP55199 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELLP55199 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELLP55199 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELLP55199 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELLP55199 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELLP55199 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELLP55199 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELLP55199 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELLP55199 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELLP55199 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELLP55199 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELLP55199 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELLP55199 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELLP55199 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELLP55199 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELLP55199 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELLP55199 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELLP55199 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELLP55199 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELLP55199 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELLP55199 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELLP55199 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELLP55199 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELLP55199 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELLP55199 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELLP55199 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELLP55199 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELLP55199 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELLP55199 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELLP55199 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELLP55199 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELLP55199 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELLP55199 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELLP55199 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELLP55199 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms