Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2A2P52657 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms