Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TUFMP49411 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUFMP49411 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TUFMP49411 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUFMP49411 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TUFMP49411 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUFMP49411 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUFMP49411 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUFMP49411 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUFMP49411 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUFMP49411 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUFMP49411 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUFMP49411 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUFMP49411 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUFMP49411 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUFMP49411 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFMP49411 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFMP49411 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFMP49411 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFMP49411 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFMP49411 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFMP49411 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFMP49411 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFMP49411 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFMP49411 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFMP49411 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFMP49411 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFMP49411 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFMP49411 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFMP49411 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFMP49411 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFMP49411 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFMP49411 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFMP49411 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFMP49411 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFMP49411 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFMP49411 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFMP49411 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFMP49411 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFMP49411 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFMP49411 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFMP49411 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFMP49411 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFMP49411 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFMP49411 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFMP49411 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFMP49411 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFMP49411 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFMP49411 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFMP49411 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFMP49411 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFMP49411 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFMP49411 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFMP49411 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFMP49411 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFMP49411 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFMP49411 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFMP49411 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFMP49411 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFMP49411 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFMP49411 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFMP49411 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFMP49411 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFMP49411 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFMP49411 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFMP49411 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFMP49411 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFMP49411 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFMP49411 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFMP49411 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFMP49411 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFMP49411 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFMP49411 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFMP49411 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFMP49411 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFMP49411 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFMP49411 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFMP49411 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFMP49411 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFMP49411 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFMP49411 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFMP49411 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFMP49411 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFMP49411 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFMP49411 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFMP49411 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFMP49411 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFMP49411 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFMP49411 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFMP49411 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFMP49411 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFMP49411 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFMP49411 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFMP49411 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFMP49411 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFMP49411 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUFMP49411 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUFMP49411 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUFMP49411 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TUFMP49411 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms