Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
IQGAP1P46940 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IQGAP1P46940 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IQGAP1P46940 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IQGAP1P46940 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IQGAP1P46940 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IQGAP1P46940 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IQGAP1P46940 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IQGAP1P46940 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IQGAP1P46940 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IQGAP1P46940 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
IQGAP1P46940 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IQGAP1P46940 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
IQGAP1P46940 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IQGAP1P46940 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IQGAP1P46940 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IQGAP1P46940 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IQGAP1P46940 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
IQGAP1P46940 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IQGAP1P46940 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IQGAP1P46940 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IQGAP1P46940 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IQGAP1P46940 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IQGAP1P46940 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IQGAP1P46940 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IQGAP1P46940 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
IQGAP1P46940 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms