Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCAMP43121 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCAMP43121 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCAMP43121 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCAMP43121 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCAMP43121 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCAMP43121 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCAMP43121 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCAMP43121 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCAMP43121 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCAMP43121 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCAMP43121 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MCAMP43121 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCAMP43121 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCAMP43121 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCAMP43121 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCAMP43121 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCAMP43121 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCAMP43121 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCAMP43121 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCAMP43121 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCAMP43121 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCAMP43121 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCAMP43121 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCAMP43121 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCAMP43121 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCAMP43121 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCAMP43121 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCAMP43121 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCAMP43121 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCAMP43121 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCAMP43121 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCAMP43121 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCAMP43121 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCAMP43121 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCAMP43121 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCAMP43121 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCAMP43121 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCAMP43121 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCAMP43121 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCAMP43121 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCAMP43121 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCAMP43121 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCAMP43121 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCAMP43121 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCAMP43121 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCAMP43121 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MCAMP43121 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCAMP43121 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCAMP43121 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCAMP43121 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCAMP43121 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCAMP43121 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCAMP43121 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCAMP43121 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCAMP43121 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCAMP43121 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCAMP43121 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCAMP43121 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCAMP43121 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCAMP43121 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCAMP43121 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCAMP43121 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCAMP43121 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MCAMP43121 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCAMP43121 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCAMP43121 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCAMP43121 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCAMP43121 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCAMP43121 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCAMP43121 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCAMP43121 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCAMP43121 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCAMP43121 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCAMP43121 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCAMP43121 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCAMP43121 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCAMP43121 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCAMP43121 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCAMP43121 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCAMP43121 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCAMP43121 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCAMP43121 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCAMP43121 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MCAMP43121 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCAMP43121 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCAMP43121 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCAMP43121 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCAMP43121 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCAMP43121 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCAMP43121 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCAMP43121 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCAMP43121 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCAMP43121 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCAMP43121 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCAMP43121 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCAMP43121 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCAMP43121 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCAMP43121 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCAMP43121 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms