Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms