Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms