Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2RAP15509 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2RAP15509 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2RAP15509 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2RAP15509 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2RAP15509 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2RAP15509 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2RAP15509 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2RAP15509 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2RAP15509 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2RAP15509 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2RAP15509 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2RAP15509 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2RAP15509 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2RAP15509 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2RAP15509 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2RAP15509 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2RAP15509 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2RAP15509 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF2RAP15509 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF2RAP15509 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF2RAP15509 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF2RAP15509 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF2RAP15509 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF2RAP15509 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF2RAP15509 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms