Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEFHP12036 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEFHP12036 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEFHP12036 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEFHP12036 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEFHP12036 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEFHP12036 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NEFHP12036 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEFHP12036 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEFHP12036 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEFHP12036 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEFHP12036 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEFHP12036 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEFHP12036 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEFHP12036 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEFHP12036 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEFHP12036 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFHP12036 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFHP12036 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFHP12036 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFHP12036 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFHP12036 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFHP12036 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFHP12036 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFHP12036 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFHP12036 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFHP12036 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFHP12036 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEFHP12036 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFHP12036 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFHP12036 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFHP12036 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFHP12036 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFHP12036 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFHP12036 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFHP12036 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFHP12036 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFHP12036 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFHP12036 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFHP12036 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFHP12036 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFHP12036 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFHP12036 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFHP12036 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFHP12036 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFHP12036 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFHP12036 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFHP12036 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFHP12036 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFHP12036 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFHP12036 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFHP12036 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFHP12036 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFHP12036 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFHP12036 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFHP12036 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEFHP12036 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEFHP12036 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEFHP12036 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEFHP12036 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEFHP12036 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEFHP12036 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEFHP12036 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEFHP12036 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEFHP12036 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEFHP12036 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEFHP12036 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms